Jean Giraud palasi Eurooppaan vuonna 1989. Hän aloitti tuolloin yhteistyön À Suivre -lehden kanssa. Giraud kirjoitti käsikirjoitusta Jim Cutlass -sarjaan omalla nimellään ja aloitti samaan aikaan työskentelyn Le Monde d’Edena -sarjan parissa, jonka juuret olivat lähtöisin vuonna 1983 Citroenille tehdystä Sur l’Étoile -promootiosarjakuvasta. Vuonna 1992 hän työskenteli jälleen Jodorowskyn kanssa graafisen Le Coeur Couronné -novellin parissa, jota julkaisi Les Humanoïdes Associés. Tarina jatkui myöhemmin La Folle du Sacré-Coeur -sarjassa.
Giraud aloitti vuonna 1994 uuden version Winsor McCayn klassikkosarjasta Pieni Nemo, jota oli piirtänyt Bruno Marchand. Giraud teki myös L’Homme de Ciguri -sarjan, joka oli pitkään odotettu jatko-osa Le Garage Hermétique -sarjalle. Hän osallistui lisäksi yhteishankkeisiin ja kirjoitti Ikarun japanilaiselle Jiro Taniguchille Morning-lehteen. Moebius liittyi vielä kerran Jodorowskyn kanssa ja piirsi eroottisen Griffes d’Ange -teoksen vuonna 1995 sekä uuden jakson Après l’Incal, jota Les Humanoïdes on julkaissut vuodesta 2000 lähtien.
Moebius on valtavan sarjakuva- ja kuvateostuotantonsa lisäksi jatkanut aktiivisesti työtään elokuvien parissa. Hän on piirtänyt storyboardeja mm. Disneylle vuonna 1980 ilmestyneeseen elokuvaan Tron. Vuonna 1985 hän tuotti käsikirjoituksen, taustat ja pukusuunnittelun Pieni Nemo -elokuvaan Tokiossa. Vuonna 1990 hän työskenteli elokuvaprojekteissa, kuten Starwatcher sekä Le Garage Hermétiquen elokuvaversiossa, joka tosin jäi julkaisematta rahoitusongelmien vuoksi.
Jean Giraud alias Moebius on kaikilla mittareilla mitattuna yksi eurooppalaisen sarjakuvateollisuuden ehdottomista huipuista. Hänen mittaamattoman rikas ja kattava tuotantonsa on viihdyttänyt sarjakuvien ystäviä useilla mantereilla jo puoli vuosisataa. Giraudin taide on omaperäistä. Se on nyansseissaan tinkimätön ja väreissään hohtava. Aiheet vaihtelevat maan päältä tulevaisuuden visioihin ja tieteellis-kuvitteellisiin maailmoihin. Ideat ovat yhtä värikkäitä kuin itse mestarin kuvitukset. Jean Giraud lukeutuu aikamme parhaimpiin taiteellisiin neroihin, jonka tuotannosta meidän eurooppalaisten tulee olla ylpeitä.